中國(guó)科學(xué)院深圳理工大學(xué)張?jiān)鲚x教授、中南大學(xué)曹東升教授、上海交通大學(xué)陳海峰教授做客我?！扒把乜茖W(xué)報(bào)告”

5月9日，應(yīng)我?？萍继?、前沿院及化學(xué)與化工學(xué)院邀請(qǐng)，中國(guó)科學(xué)院深圳理工大學(xué)張?jiān)鲚x教授、中南大學(xué)曹東升教授和上海交通大學(xué)陳海峰教授做客我校“前沿科學(xué)報(bào)告”，作了題為“蛋白質(zhì)相互作用的理論計(jì)算方法與應(yīng)用”“人工智能藥物設(shè)計(jì)方法與應(yīng)用研究”和“無(wú)規(guī)蛋白環(huán)境特異的精準(zhǔn)分子力場(chǎng)研究及應(yīng)用”的報(bào)告。報(bào)告會(huì)由化學(xué)與化工學(xué)院副院長(zhǎng)仝建波主持，學(xué)院相關(guān)專業(yè)教師、研究生聆聽(tīng)了此次報(bào)告會(huì)。

張?jiān)鲚x教授介紹了課題組在計(jì)算預(yù)測(cè)蛋白—配體和蛋白—蛋白相互作用的結(jié)合自由能及其蛋白變異對(duì)結(jié)合自由能的定量影響的計(jì)算方法的研究。這些方法的應(yīng)用為認(rèn)識(shí)和設(shè)計(jì)蛋白—配體及蛋白—蛋白相互作用提供了重要和精確定量的原子層面的信息，其理論計(jì)算和預(yù)測(cè)的精度在不斷趨近于實(shí)驗(yàn)誤差范圍，這些自由能理論計(jì)算方法的不斷發(fā)展和應(yīng)用將對(duì)藥物設(shè)計(jì)，抗體設(shè)計(jì)和蛋白設(shè)計(jì)提供具有實(shí)際意義的理論計(jì)算指導(dǎo)。

曹東升教授從創(chuàng)新藥物發(fā)現(xiàn)亟待變革性新模式的背景出發(fā)，介紹了課題組運(yùn)用各種人工智能技術(shù)、機(jī)器學(xué)習(xí)方法、分子模擬、計(jì)算化學(xué)、化學(xué)信息學(xué)以及生物信息學(xué)技術(shù)來(lái)實(shí)現(xiàn)自動(dòng)的問(wèn)題假設(shè)生成，活性預(yù)測(cè)和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證研究。重點(diǎn)介紹了基于結(jié)構(gòu)/配體的虛擬篩選方法、成藥性理論預(yù)測(cè)和分子靶標(biāo)識(shí)別展開(kāi)了系統(tǒng)和深入的方法學(xué)研究，并把發(fā)展的方法與實(shí)驗(yàn)平臺(tái)無(wú)縫銜接用于多個(gè)重要靶點(diǎn)的藥物分子設(shè)計(jì)和生物活性分子的作用靶標(biāo)識(shí)別。

陳海峰教授報(bào)告了課題組通過(guò)矯正八個(gè)無(wú)規(guī)傾向性的氨基酸、二十種氨基酸、八十種氨基酸環(huán)境的CMAP參數(shù)，發(fā)展了ff99IDPs,ff14IDPs,ff14IDPSFF, ff03CMAP, ESFF1等系列精準(zhǔn)的無(wú)規(guī)蛋白分子力場(chǎng)，新力場(chǎng)能重現(xiàn)天然無(wú)規(guī)蛋白的構(gòu)象特征，并準(zhǔn)確預(yù)測(cè)天然無(wú)規(guī)蛋白的化學(xué)位移、J-Coupling、NOE等參數(shù)。與現(xiàn)有分子力場(chǎng)相比，精準(zhǔn)力場(chǎng)對(duì)天然無(wú)規(guī)蛋白的模擬更加精確而且更加高效。

報(bào)告最后，三位教授就師生們的相關(guān)問(wèn)題進(jìn)行了細(xì)致解答，使得師生們對(duì)報(bào)告內(nèi)容有了更深入的理解。本次學(xué)術(shù)報(bào)告開(kāi)闊了化工學(xué)院在化學(xué)信息學(xué)和生物信息學(xué)方面的科學(xué)視野，促進(jìn)了師生在相關(guān)領(lǐng)域的學(xué)術(shù)交流。

新聞小貼士：

張?jiān)鲚x，華東師范大學(xué)教授，上海紐約大學(xué)計(jì)算化學(xué)聯(lián)合研究中心主任, 深圳理工大學(xué)合成學(xué)院講席教授。在國(guó)際核心學(xué)術(shù)刊物上發(fā)表論文400余篇，論文引用13,000余次，H-index指數(shù)60 (web of science)，目前擔(dān)任Phys. Chem. Chem. Phys. 的副編輯。

曹東升，中南大學(xué)湘雅藥學(xué)院教授。發(fā)表SCI論文100余篇，開(kāi)發(fā)軟件平臺(tái)35套，獲軟件著作權(quán)22項(xiàng), 累計(jì)訪問(wèn)540萬(wàn)余次；申請(qǐng)中國(guó)專利13項(xiàng)，參編英文專著一部。獲得國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目、湖南省重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、湖南省杰出青年基金等國(guó)家、省部級(jí)和橫向科研項(xiàng)目20余項(xiàng)，累計(jì)經(jīng)費(fèi)1500余萬(wàn)?，F(xiàn)任湖南省生物醫(yī)學(xué)信息委員會(huì)副主任委員，中國(guó)計(jì)算機(jī)化學(xué)專業(yè)委員會(huì)委員，中國(guó)計(jì)算毒理學(xué)專業(yè)委員會(huì)委員。受邀擔(dān)任SCI期刊CMES-Comp. Model. Eng.副主編和Chemometr. Intell. Lab.編委。

陳海峰，上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院微生物代謝國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室教授，博士生導(dǎo)師，生物信息學(xué)與生物統(tǒng)計(jì)學(xué)系副系主任。Chemical Biology &Drug Design雜志副主編。上海市浦江人才。主要從事天然無(wú)規(guī)蛋白的精準(zhǔn)分子力場(chǎng)、計(jì)算合成生物學(xué)以及計(jì)算機(jī)輔助創(chuàng)新藥物發(fā)現(xiàn)等研究。迄今為止已在JACS, PNAS, NAR，Bioinformatics，JCTC等國(guó)際著名學(xué)術(shù)期刊發(fā)表了130多篇SCI論文。文章引用超過(guò)2500次。H因子為28。獲上海市科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)。主持五項(xiàng)國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目, 參與三項(xiàng)國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃子課題。

（核稿：仝建波 編輯：郭姍姍）